Работал под руководством Эйгена Блейлера в клинике Бургхольцли (Burgholzi) в Цюрихе (1904-07), где в это же время работал К. Г. Юнг, затем частнопрактикующим врачом в Берлине. В 1907 знакомится с Фрейдом. В течение всей жизни Абрахам сохранял близость Фрейду, с течением времени отмежевавшись от К. Г.Юнга. В 1910 он организовывает Берлинскую психоаналитическую ассоциацию (первое отделение Психоаналитического общества за пределами Вены), в 1924 становится его президентом. На базе этой организации была создана клиника, благодаря которой Берлин стал важным центром подготовки психоаналитиков.
Основное внимание Абрахама было сосредоточено на психоаналитической терапии психозов, в особенности маниакально-депрессивного. Ранняя смерть помешала ему в полной мере развить ту теорию фантазии, основы которой он заложил своими работами по исследованию объектных отношений в развитии ребенка. Она была впоследствии разработана другими психоаналитиками, более всего школой М. Кляйн. Он ввел понятие частичного объекта, описал процессы интроекции и инкорпорации. Из собственных его разработок, посвященных этой теме, заслуживает внимания идея о связи мифов с мечтами; по его мнению, те и другие являются видом фантазийного исполнения желаний.
Он выделил шесть стадий развития либидо у ребенка: ранняя оральная, орально-садистская, анальная изгоняющая, анальная удерживающая, фаллическая, генитальная. Он разработал концепцию психоза, которая заключается в том, что при нарушении нормального хода развития ребенка либидо как бы застревает на одной из промежуточных стадий. Но применение им этой концепции к маниакально-депрессивному психозу нельзя считать удачным.